Một năm có thể thay đổi cuộc đời của một người mãi mãi. 365 ngày Lớp 3-E của trường trung học cơ sở Kunugigaoka đã trải qua với giáo viên lập dị của họ, Koro-sensei, chắc chắn là như vậy. Mang theo những kỷ niệm của năm đó gần với trái tim của họ, các cựu sinh viên Nagisa Shiota và Karma Akabane trở lại lớp học cũ của họ để nhớ lại những sự kiện trong khoảng thời gian quan trọng đó của cuộc đời họ. Nagisa và Karma được nhắc nhở bởi những căn phòng quen thuộc, bàn làm việc, bảng phấn và album lớp về những sự kiện đã biến họ thành "sát thủ" và chuẩn bị cho họ bước vào thế giới thực. Đó là di sản của giáo viên giống bạch tuộc của họ - người đã tự giới thiệu mình bằng cách đe dọa sẽ hủy diệt thế giới nếu họ không giết anh ta vào cuối năm học - và thời gian ở trong "Lớp học ám sát" kỳ lạ nhưng đặc biệt.