Những sinh vật nguyên thủy ma quái được gọi là Mushi tiếp tục gây ra những thay đổi bí ẩn trong cuộc sống của con người. Mushishi du hành, Ginko, kiên trì cố gắng sắp đặt đúng những tình huống kỳ lạ và đáng lo ngại mà anh ta gặp phải. Vòng lặp thời gian, bóng sống và thần giao cách cảm là một trong những tác động công khai của sự can thiệp từ Mushi, nhưng các triệu chứng phức tạp hơn mà phải mất nhiều năm mới được nhận thấy cũng khơi dậy mối quan tâm của Ginko khi anh đi từ làng này sang làng khác. Thông qua hoàn cảnh, Ginko đã trở thành một trọng tài, xác định Mushi nào là phước lành và đâu là lời nguyền. Nhưng những đường nét mà anh ta tìm cách vẽ là chủ quan. Một số bệnh nhân của ông ta muốn thực hiện sức mạnh mới của họ cho đến khi họ hoàn toàn bị chúng tiêu thụ; những người khác cố gắng một cách tuyệt vọng để thoát khỏi phiền não mà trên thực tế là bảo vệ cuộc sống của họ khỏi sự tàn phá. Những người vượt qua con đường với Mushi phải học cách chấp nhận những hậu quả dường như không thể xảy ra cho hành động của họ, và chữa lành những vết thương mà họ không biết mình mắc phải. Nếu không, họ có nguy cơ gặp những số phận ngoài tầm hiểu biết của họ.