Shinichi Kudou, một học sinh trung học có tài năng đáng kinh ngạc trong công việc thám tử, nổi tiếng vì đã giải quyết một số vụ án đầy thách thức. Một ngày nọ, khi Shinichi phát hiện ra hai người đàn ông đáng ngờ và quyết định theo dõi họ, anh vô tình trở thành nhân chứng cho một hoạt động phi pháp đáng lo ngại. Thật không may, anh ta bị bắt quả tang, vì vậy những người đàn ông đã cho anh ta uống một loại thuốc thử nghiệm do tổ chức tội phạm của họ điều chế, khiến anh ta chết. Tuy nhiên, trước sự ngạc nhiên của chính mình, Shinichi vẫn sống để nhìn thấy một ngày khác, nhưng bây giờ trong cơ thể của một đứa trẻ bảy tuổi. Giữ gìn hoàn hảo trí thông minh ban đầu của mình, anh che giấu danh tính thực sự của mình với mọi người, kể cả người bạn thời thơ ấu Ran Mouri và cha cô, thám tử tư Kogorou Mouri. Cuối cùng, anh ta lấy bí danh là Conan Edogawa, lấy cảm hứng từ các nhà văn bí ẩn Arthur Conan Doyle và Ranpo Edogawa. Thám tử lừng danh Conan theo chân Shinichi, với tư cách là Conan, bắt đầu bí mật giải quyết các vụ án của Mouri cấp cao từ phía sau hậu trường bằng kỹ năng điều tra đặc biệt của mình, đồng thời bí mật điều tra tổ chức chịu trách nhiệm về tình trạng hiện tại của anh ta, hy vọng một ngày nào đó sẽ đảo ngược tác dụng của thuốc.