Sau sự sụp đổ cuối cùng của Bakugan Naga lừa đảo, hòa bình đã được đưa trở lại Vestroia. Với sự giúp đỡ của Danma Kuusou, người bạn đồng hành của anh ấy là Pyrus Dragonoid và các Battle Brawlers khác, Infinity và Silent Cores đã được kết hợp và vương quốc được tái tạo. Tuy nhiên, New Vestroia sẽ không có bất kỳ thời gian nghỉ ngơi nào khi những kẻ xâm lược ngoài hành tinh hình người, Vestals, đến và chinh phục thế giới Bakugan chỉ trong một cú trượt ngã. Được trang bị một cỗ máy đáng sợ có khả năng hạn chế Bakugan ở dạng bóng của chúng, chúng nhằm mục đích biến chủng tộc thành nô lệ như một hình thức giải trí. Giờ đây, lực lượng duy nhất cản đường họ là Bakugan Battle Brawlers Resistance một nhóm người, Bakugan và Vestals phản đối ý tưởng tiêu diệt một chủng tộc có tri giác. Được dẫn dắt bởi Danma, họ phải dấn thân vào New Vestroia do kẻ thù chiếm đóng và đẩy lùi quân xâm lược, để đảm bảo sự tồn vong của toàn thế giới.