Cánh cổng vào Thế giới số đã đóng ba năm rồi. Taichi Yagami và những người bạn của anh ấy đã chuyển đi, và bây giờ anh ấy đang học năm thứ hai trung học, đã đến lúc anh ấy trưởng thành. Trong khi những người khác biết họ muốn làm gì với cuộc sống của mình, Taichi vẫn không chắc chắn. Trong khi đó, cả nhóm ngày càng xa nhau khi họ đi theo con đường của riêng mình. Một ngày nọ, một Digimon hình côn trùng giả mạo tên là Kuwagamon xuất hiện và phá vỡ các thiết bị điện tử trên toàn thành phố. Taichi liều lĩnh đuổi theo nó và bị Digimon tấn công vào chân tường. Đột nhiên, Digivice mà anh ấy vẫn mang theo một thiết bị kỹ thuật số phục vụ nhiều mục đích khác nhau, bao gồm cả việc giúp đối tác Digimon của một người tiến hóa phát sáng và Agumon xuất hiện. Cả hai đều có thể đánh bại Kuwagamon, nhưng tại sao Digimon lại đến thế giới này ngay từ đầu? Điều gì đang xảy ra trong Thế giới kỹ thuật số và chính xác thì điều này liên quan đến Meiko Mochizuki, học sinh mới chuyển đến trong lớp của Taichi như thế nào?