Trong khi tìm kiếm trên gác mái của ông mình, Hikaru Shindou tình cờ tìm thấy một bàn cờ cũ. Chạm vào nó, anh ta được chào đón bởi một giọng nói bí ẩn, và ngay sau đó bất tỉnh. Khi tỉnh lại, anh phát hiện ra rằng giọng nói đó vẫn còn tồn tại và thuộc về Fujiwara no Sai, linh hồn của một chuyên gia cờ vây cổ đại. Là người hướng dẫn cờ vây cho Hoàng đế Nhật Bản trong Thời đại Heian, niềm đam mê của Sai đối với trò chơi vượt thời gian và không gian, cho phép anh tiếp tục chơi trò chơi yêu thích của mình như một thực thể ma quái. Mục tiêu cuối cùng của Sai là thành thạo một kỹ thuật cờ vây thần thánh mà cho đến nay chưa có người chơi nào đạt được, và anh ấy tìm cách đạt được điều này bằng cách chơi trò chơi cờ thông qua Hikaru. Mặc dù không có hứng thú với trò chơi cờ bàn, Hikaru miễn cưỡng đồng ý chơi, thực hiện các động tác theo chỉ dẫn của Sai. Tuy nhiên, khi gặp thần đồng cờ vây trẻ tuổi Akira Touya, niềm đam mê cờ vây dần bùng cháy trong anh. Lấy cảm hứng từ đối thủ mới của mình, hành trình của Hikaru vào thế giới cờ vây chỉ mới bắt đầu.