Trường trung học Otonokizaka đã được cứu! Mặc dù phải rút khỏi Love Live !, những nỗ lực của μ's đã có thể thu hút đủ sự quan tâm đến trường học của họ để ngăn nó đóng cửa. Còn gì nữa, sau phần kết của Love Live thứ nhất, thứ hai! được công bố, lần này trên một sân khấu thậm chí còn lớn hơn trước. Được trao cơ hội chuộc lỗi, chín cô gái lại cùng nhau một lần nữa để hát hết mình và khẳng định chiến thắng. Tuy nhiên, với thời điểm cuối năm học đang đến gần, thời điểm tốt nghiệp của các năm thứ ba cũng đến gần. Khi họ cố gắng đạt đến đỉnh cao của Love Live !, họ cũng phải xem xét tương lai của mình và chọn con đường mà nhóm sẽ đi. Mặc dù câu hỏi về việc có nên tiếp tục mà không có năm thứ ba hay sẽ tan rã luôn đè nặng trong tâm trí các thành viên, μ's phải nhanh chóng đi đến câu trả lời với lễ tốt nghiệp sắp diễn ra. Love Live! School Idol Project mùa thứ 2 tiếp tục câu chuyện của các cô gái khi họ cười, khóc, hát và nhảy trong hành trình xác định tương lai của nhóm và chinh phục Love Live! trong cơ hội cuối cùng của họ để giành chiến thắng với tất cả chín cô gái cùng nhau.